强烈建议应用程序服务器使用 NTFS 文件系统。与 FAT 和 FAT32 相比，NTFS 是更强大和更安全的文件系统。可以使用 NTFS 限制对 Web 服务器文件和目录的访问。也可以配置给某个用户或组授予的服务器文件和目录访问级别。除了允许使用比 FAT 更大的卷大小外，NTFS 还具有其他优点（如下表所示）。
| NTFS | FAT |
|---|---|
| 允许管理员使用 NTFS 权限保护目录和文件。可以在文件或目录级别设置权限。 | 不允许管理员保护目录和文件。 |
| 支持文件加密（它可大大增强文件的安全性）。 | 不支持文件加密。 |
| 允许管理员启用 Web 分布式创作和版本控制 (WebDAV) 属性。 | 不允许管理员启用 WebDAV 属性。 |
| 支持基于 Active Directory® 和域的安全功能。 | 不支持基于 Active Directory 和域的安全功能。 |
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